Il soggetto della frase è L'istituto comprensivo, quindi il verbo va concordato al singolare. La concordanza al plurale è accettabile soltanto in un contesto informale (quale non sembra essere quello in questione). Attenzione: bisogna anche chiudere il complemento incidentale con una virgola, pertanto:  "L'istituto comprensivo... nelle persone della Dirigente, i docenti, il personale ATA, desidera..."
Fabio Ruggiano